Pasilla RNA-seq 三人协作
本案例用一个报告任务演示三人协作：A 负责需求与评审，B 计算计数质控和子集 CPM，C 使用 B 已采纳的结果做描述性比较。重点是把工作交给成员、评审某一版成果，再把它传给下游。
首次使用请先完成协作使用说明中的登录、设备连接和模型准备。
本页截图来自一次真实的三账号协作演示，完整展示了需求确认、成员交付、返修、采纳、下游接力与结项。
输入与分工
数据来自 Bioconductor pasilla 公开果蝇 RNA-seq 计数数据。演示使用原始表头和前 50 个基因 × 7 个样本，保持顺序及数值不变，配套使用样本注释。
这 50 行是原表顺序摘录，不是代表性抽样。子集 CPM 的分母仅为每个样本这 50 个基因的计数之和，不是完整测序文库大小，不用于全转录组归一化或显著性检验。
| 人员 | 工作 | 本轮交付 |
|---|---|---|
| A：负责人 | 确认需求、邀请成员、调整派单、返修、采纳和结项 | 两项采纳记录及项目总结 |
| B：成员 | 计算 7 个样本的摘录总计数和 50 基因的子集 CPM | 两版 README，以及独立的 member-qc-notes.md 成员说明 |
| C：成员 | 读取 B 已采纳的第 2 版，比较 treated / untreated 组均值 | 一版描述性比较 README |
跟随案例操作时，先从公开来源准备计数数据和样本注释，再将输入提供给项目。
1. A 写需求并确认两个串行模块
A 在需求页写入真实摘录、输出范围和依赖：B 先出 QC 与子集 CPM 报告；C 只使用 B 被采纳的版本。补全后，A 检查模块，再确认需求。
可参考以下目标写法，并在输入区域补齐实际数据和样本注释：
模块 1：根据所附 50 基因 × 7 样本计数，报告每样本的摘录总计数、
子集 CPM、零计数比例和列和校验。README 包含方法、可复算代码和限制。
允许成员另附自己的检查说明，由负责人预览和评审。
模块 2：依赖模块 1 已采纳的结果，读取其报告和成员说明，比较
treated 与 untreated 组的平均子集 CPM，列出绝对均值差最大的 5 个基因。
只做描述性比较，不报告 p 值、FDR 或显著性结论。
图 1：输入、输出范围和依赖写进任务说明，供成员接单前阅读。
观察点：C 的模块依赖 B 已采纳的成果，不能把“B 的 AI 写完了”当作下游启动条件。
2. A 邀请成员并把模块 1 分配给 B
确认需求后，A 邀请 B、C 加入，并检查任务分配。系统初始分配与目标分工不同，A 通过界面把模块 1 改派给 B；B 阅读任务后接受。
图 2：模块 1 的成员为 B；模块 2 留在收集箱，等待模块 1 采纳。
观察点：以任务卡上的成员和状态为准，不要只根据自然语言分工推断派单结果。
3. B 检查草稿并提交两份文件
本机 AI 生成 README 后，B 预览报告，通过添加资料 → 从本机上传加入 member-qc-notes.md，并编辑结果说明。第 1 版清单包含 AI README 和成员说明两项。
图 3：成员审阅后确认提交，附加说明作为独立文件保留。
提交前，B 检查了 350 个子集 CPM 数值，并在结果说明中记录计算方法、核对结果和需要负责人评审的内容。
操作要点：提交前同时检查文件正文和结果说明，确保数值、文字及本次完成内容一致。
4. A 提出返修，B 提交第 2 版
A 预览封存的第 1 版，通过要求修改让 B 更正评审状态描述、保留独立说明，并增加每样本零计数数量、比例和 CPM 列和校验。
B 修改后重新审阅、提交第 2 版，A 预览这一版并采纳。第 1 版仍保留在历史中。
图 4：新版用于本次评审，旧版仍可展开查看。
观察点：返修形成新的交付版本；采纳前应明确预览的是哪一版。
5. C 接受下游任务并读取已采纳结果
B 第 2 版被采纳后，模块 2 才具备派单条件。A 在接单前将该模块调整给 C，C 接受并执行。系统把 B 第 2 版 README 和成员说明放入 C 的任务输入，无需手动复制。
图 5：项目已采纳 1/2，下游 C 正在执行。
下游使用 B 已采纳的第 2 版文件，C 可以直接在自己的任务中读取这些输入并继续分析。
6. C 预览报告，A 采纳并结项
C 预览报告，确认只使用已采纳输入并保留描述性分析限制，再提交。A 预览 C 的封存报告并采纳，全部模块完成后填写总结、确认结项。
图 6：报告限定数据范围，不把均值差解释为统计显著性。
图 7：两个模块均完成，项目本身也已结项。
案例成果
| 环节 | 完成结果 |
|---|---|
| 需求补全与确认 | 两个带依赖的真实工作模块 |
| 审阅与添加资料 | AI README 与成员说明一起封存 |
| 返修与版本保留 | B 两版交付，A 采纳第 2 版 |
| 下游接力 | C 使用 B 已采纳的第 2 版报告及成员说明 |
| 人工采纳与结项 | 两模块采纳，项目最终已完成 |
本案例展示了从需求到交付的完整协作流程。分析采用数据摘录和描述性比较，阅读结果时应结合相应的数据范围与方法。
继续阅读
- 协作使用说明：按钮路径、状态、失败处理和数据边界。
- Runtime 与模型：准备执行环境与结构化输出配置。
- 功能状态与限制：当前版本支持范围。